在探望初中同学“琉璃”回家的路上，主角“鹫崎日正”接触到了一根羽毛“神羽”。有关于“神圣创世之战”的记忆，这是人类诞生前在远古宇宙中为宇宙命运而战的正义战士雷丁与邪恶生命体和超级恶魔之间的战斗。结果，雷霆战士取得了胜利，超级恶魔被放逐到了次元的另一边。然而，在今天，超级恶魔复活并开始入侵地球。飞行对自己的命运感到困惑，但他决定为保护他的姐妹而战。
